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2015

The draft genome of the grass carp (Ctenopharyngodon idellus) provides…

작성자 채식영양
작성일 16-07-23 21:13 | 조회 253 | 댓글 0

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Wang, Y., et al. (2015). "The draft genome of the grass carp (Ctenopharyngodon idellus) provides insights into its evolution and vegetarian adaptation." Nat Genet 47(6): 625-631.

The grass carp is an important farmed fish, accounting for approximately 16% of global freshwater aquaculture, and has a vegetarian diet. Here we report a 0.9-Gb draft genome of a gynogenetic female adult and a 1.07-Gb genome of a wild male adult. Genome annotation identified 27,263 protein-coding gene models in the female genome. A total of 114 scaffolds consisting of 573 Mb are anchored on 24 linkage groups. Divergence between grass carp and zebrafish is estimated to have occurred 49-54 million years ago. We identify a chromosome fusion in grass carp relative to zebrafish and report frequent crossovers between the grass carp X and Y chromosomes. We find that transcriptional activation of the mevalonate pathway and steroid biosynthesis in liver is associated with the grass carp's adaptation from a carnivorous to an herbivorous diet. We believe that the grass carp genome could serve as an initial platform for breeding better-quality fish using a genomic approach.

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Wang, Y., et al. (2015). "초어 (Ctenopharyngodon idellus)의 게놈 초안은 진화와 채식주의 적응에 대한 통찰력을 제공한다." Nat Genet 47 (6) : 625-631.

잔디 잉어 (grass carp)는 중요한 양식 어류로 전세계 담수 양식의 약 16 %를 차지하며 채식을합니다. 여기에 우리는 성숙한 여성 성인의 0.9-Gb 초안 게놈과 야생 남성 성인의 1.07-Gb 게놈을보고합니다. 게놈 주석은 여성 게놈에서 27,263 개의 단백질 코딩 유전자 모델을 확인했습니다. 573Mb로 구성된 총 114 개의 발판이 24 개의 연결 그룹에 고정되어 있습니다. 잔디 잉어와 제브라 피쉬 사이의 발산은 49 억 5 천 4 백만 년 전으로 추정됩니다. 우리는 제브라 피쉬에 비해 잔디 잉어에서 염색체 융합을 확인하고 잔디 잉어 X와 Y 염색체 사이에 빈번한 교차를보고합니다. 우리는 간에서의 메 발로 네이트 경로와 스테로이드 생합성의 전사 활성화가 초식에서 육식으로의 적응과 관련이 있음을 발견했다. 우리는 초어 잉어 게놈이 게놈 접근법을 사용하여 양질의 어류를 사육하기위한 초기 플랫폼으로 사용될 수 있다고 믿습니다. 

 

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